129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2287 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  100 
 
 
250 aa  497  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  51.44 
 
 
256 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  48.36 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
264 aa  202  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  44.49 
 
 
269 aa  202  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  41.43 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  42.45 
 
 
253 aa  194  8.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  42.45 
 
 
256 aa  191  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  42.57 
 
 
250 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  42.57 
 
 
250 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  43.95 
 
 
255 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  41.63 
 
 
255 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  42.34 
 
 
253 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  43.55 
 
 
255 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  43.44 
 
 
254 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  41.77 
 
 
250 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  35.89 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  35.89 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  41.77 
 
 
250 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  43.03 
 
 
254 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  39.51 
 
 
246 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  36.63 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  38.33 
 
 
249 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
246 aa  151  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  37.08 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  39.34 
 
 
249 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  40.94 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  40.94 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  40.94 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  40.62 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  41.73 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  41.73 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  34.3 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  38.66 
 
 
255 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  37.3 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  33.55 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  36.51 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  37.6 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  42.4 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  39.37 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  41.07 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  38.28 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  29.77 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  37.9 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  31.61 
 
 
242 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  30.2 
 
 
405 aa  60.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  29.01 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  29.01 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  28.24 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  28.24 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  28.24 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
261 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  28.24 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  35.71 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  38.76 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  32.12 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  28.99 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  34.92 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.63 
 
 
308 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  24.46 
 
 
310 aa  52  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  26.29 
 
 
260 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  32.03 
 
 
275 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  25.5 
 
 
259 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.08 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.08 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  32.08 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  32.08 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.08 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.08 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  30 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  29.17 
 
 
248 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.13 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
273 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  24.65 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.13 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.03 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>