More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0749 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 308 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  60.19 
 
 		 311 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  53.75 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  50.17 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  45.97 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  47.23 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  43.04 
 
 		 329 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  44.66 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  48.18 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  44.01 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  43.09 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  38.67 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  35.37 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  36.84 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  35.04 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  35.04 
 
 		 255 aa  126  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  33.58 
 
 		 447 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  32.99 
 
 		 436 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  36.32 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  35.47 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  35.57 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.64 
 
 		 561 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.64 
 
 		 561 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  36.02 
 
 		 436 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  34.44 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  32.18 
 
 		 439 aa  95.9  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  30.88 
 
 		 456 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  28.32 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  31.45 
 
 		 456 aa  82.4  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  23.68 
 
 		 577 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  23.68 
 
 		 577 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  22.44 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  21.72 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  34.38 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  20.34 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  31.86 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  31.05 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  27.12 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  34.69 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.63 
 
 		 244 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  38.95 
 
 		 280 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 244 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  38.95 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  38.89 
 
 		 658 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  33.56 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1178  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 186 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.140989 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  31.53 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  40.22 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  31.9 
 
 		 700 aa  50.8  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.61 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  31.68 
 
 		 229 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.84 
 
 		 208 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 236 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.49 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  32.89 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 207 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 226 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 258 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 219 aa  50.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1444  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.55 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 210 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 263 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.66 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  38.61 
 
 		 249 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  35.67 
 
 		 268 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  30.15 
 
 		 214 aa  48.9  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  24.35 
 
 		 219 aa  48.9  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  27.27 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  32 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  30.93 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  41.1 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 415 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  26.74 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.3 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1843  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>