216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00330 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  100 
 
 
405 aa  829    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  23.93 
 
 
310 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 
305 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  27.76 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  28.67 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  39.05 
 
 
249 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  30.93 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  33.95 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  31.68 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  32.93 
 
 
249 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  31.1 
 
 
250 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  27.46 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
264 aa  67  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  29.75 
 
 
248 aa  63.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  30.36 
 
 
249 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 
255 aa  63.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  24.07 
 
 
246 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  25 
 
 
256 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  25 
 
 
256 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
255 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  25.5 
 
 
256 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
255 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  35.09 
 
 
311 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 
254 aa  59.7  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
273 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
270 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
275 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
243 aa  56.6  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  40.48 
 
 
261 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  34.69 
 
 
258 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
245 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
259 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  33.33 
 
 
261 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.02 
 
 
254 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
260 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
258 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
243 aa  53.5  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.71 
 
 
261 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
239 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
246 aa  53.1  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
239 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3579  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase protein  32.41 
 
 
280 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
239 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
242 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.4 
 
 
257 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
267 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  29.37 
 
 
243 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
261 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 
252 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
248 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
246 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.56 
 
 
268 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
271 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.68 
 
 
257 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  31 
 
 
253 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  30.63 
 
 
255 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
268 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2506  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.67 
 
 
248 aa  50.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117869  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
256 aa  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  32.67 
 
 
200 aa  50.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
261 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.97 
 
 
258 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.36 
 
 
256 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  29.63 
 
 
273 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  32.35 
 
 
268 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 
250 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  29.79 
 
 
727 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
275 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
256 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
253 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 
495 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.68 
 
 
248 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
250 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  29.5 
 
 
232 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  25.15 
 
 
312 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  26.25 
 
 
267 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 
269 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  30.51 
 
 
275 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 
350 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
265 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
279 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
242 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  26.79 
 
 
265 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
258 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  33.33 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  33.33 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
258 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  29.73 
 
 
265 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  26.92 
 
 
220 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  26.92 
 
 
220 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.97 
 
 
255 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.29 
 
 
269 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.07 
 
 
259 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
226 aa  47.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.46 
 
 
258 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12710  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.63 
 
 
198 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>