More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4526 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  100 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  48.76 
 
 		 250 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  48.36 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  49.58 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  47.93 
 
 		 254 aa  218  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  44.67 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  49.33 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  44.08 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  42.98 
 
 		 253 aa  198  9e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  41.95 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  40.08 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  45.61 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  44.27 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  44.27 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  40.64 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  39.76 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  38.52 
 
 		 249 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  37.7 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  36.48 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  32.68 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  34.76 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  25.31 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  28.62 
 
 		 305 aa  89  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  43.06 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  32.42 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  41.22 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  34.27 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 260 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  27.08 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  32.64 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.92 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  27.63 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  38.19 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  35.82 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  36.36 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3579  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase protein  31.48 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  34.33 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  26.77 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  26.77 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  26.77 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  26.77 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.52 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  26.77 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  32.52 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  26.77 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.52 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  26.77 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.52 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.71 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  31.71 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  31.4 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.71 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  32.56 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  34.75 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  22.94 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  26.01 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.71 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2323  hypothetical protein  26.42 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.569628  normal  0.0283599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.08 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  37.62 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  39.73 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  24.53 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>