More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0328 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  100 
 
 
259 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  51.94 
 
 
271 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  49.38 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
254 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  45.54 
 
 
246 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  42.31 
 
 
275 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  41.28 
 
 
255 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  42.15 
 
 
242 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  54.11 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  45.96 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  36.09 
 
 
257 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  42.06 
 
 
247 aa  128  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  50 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  49.3 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  39.71 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  40 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  42.25 
 
 
245 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  42.42 
 
 
260 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 
243 aa  122  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  36.16 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  44.44 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  36.16 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
257 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  42.75 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  29.69 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  29.17 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  29.17 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 
254 aa  92  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  31.51 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.57 
 
 
308 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  28.65 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  28.12 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  29.82 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.79 
 
 
265 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  37.4 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  38 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  43.28 
 
 
284 aa  78.6  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  38 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.58 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  36.36 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  27.5 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0312  hypothetical protein  29.92 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.763248  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  36.43 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  37.31 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  32.95 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  38.4 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  38.78 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  35.34 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  37.6 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  36.43 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  39.53 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  29.58 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29451  hypothetical protein  32.37 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  26.52 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  31.2 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  37.8 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  38.17 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  36.64 
 
 
275 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  32 
 
 
495 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  36.88 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  26.87 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  26.87 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.7 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
248 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  25.11 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  25.47 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
252 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  28.68 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  29.3 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  38.04 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  34.38 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  29.32 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  40.68 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  30.08 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  24.44 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  36.23 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  24.44 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03990  expressed protein  29.89 
 
 
364 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.97 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>