More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0663 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  95.29 
 
 
255 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  64.03 
 
 
255 aa  341  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  60.8 
 
 
255 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  50.2 
 
 
257 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  50.6 
 
 
259 aa  261  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  55.02 
 
 
260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  54 
 
 
256 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  38.27 
 
 
239 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  38.27 
 
 
239 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  40.76 
 
 
246 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
239 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  39.83 
 
 
242 aa  141  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  37.65 
 
 
254 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  38.37 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  36.44 
 
 
243 aa  135  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  37.35 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  38.84 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  36 
 
 
263 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  37.34 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  46.38 
 
 
271 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  36.16 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  33.2 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  39.41 
 
 
243 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 
252 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
270 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  35.77 
 
 
251 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  35.77 
 
 
251 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  35.77 
 
 
251 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  35.77 
 
 
251 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  35.77 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  35.04 
 
 
251 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  25.38 
 
 
333 aa  98.6  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 
249 aa  95.1  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  38.62 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  34.31 
 
 
251 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  37.58 
 
 
242 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  38.22 
 
 
263 aa  85.1  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.1 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  29.48 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  31.69 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03990  expressed protein  26.55 
 
 
364 aa  79  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  32.39 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.57 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  40.31 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  36.5 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  40.3 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  33.33 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.18 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  36.65 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0312  hypothetical protein  30.71 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.763248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  33.58 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  38.35 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  30.4 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  31.11 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  26.16 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
275 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
188 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  33.59 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  40 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  38.52 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  38.35 
 
 
250 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  29.1 
 
 
259 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  36.76 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  28.65 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  35.29 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  35.07 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
271 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  25.14 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
277 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
254 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  35.58 
 
 
255 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  35.38 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  29.84 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  25.74 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>