More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3409 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  100 
 
 
263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  46.34 
 
 
265 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  46 
 
 
261 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  38.82 
 
 
254 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  36.6 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  34.76 
 
 
246 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  34.21 
 
 
255 aa  89  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  33.04 
 
 
243 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  41.61 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  42.22 
 
 
284 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  34.33 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  39.46 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  41.48 
 
 
273 aa  85.5  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  38.22 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  43.28 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  33.49 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  30.87 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  33.49 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  33.49 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  38.93 
 
 
256 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  43.51 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  26.27 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  36.94 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  30.08 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  49.07 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  38 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0734  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599547  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  25.49 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  39.71 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  39.38 
 
 
256 aa  79  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  38.13 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  24.4 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  24.4 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  24.4 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  36.09 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  28.09 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  28.52 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  24 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  35.23 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  24.4 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  35.88 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  39.1 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  35.34 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.93 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  37.41 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  37.68 
 
 
495 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  35 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  37.4 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  42.48 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  36.43 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  29.34 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  26.43 
 
 
310 aa  67  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  35.26 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  32.19 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  36.57 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  35.51 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  40 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  39.69 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  40.6 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  32.85 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  41.54 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  38.61 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  34.11 
 
 
206 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  26.88 
 
 
333 aa  62.4  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
317 aa  62  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
327 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  37.21 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  25.33 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  45.83 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2566  Methyltransferase type 11  37.32 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  45.83 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0499  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.29 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  34.56 
 
 
225 aa  60.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  31.54 
 
 
206 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  47.47 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  45.45 
 
 
225 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  20.43 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>