130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0200 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2323  hypothetical protein  31.91 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.569628  normal  0.0283599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  33.46 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  30.88 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3579  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase protein  27.88 
 
 		 280 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  27.38 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0450  methyltransferase type 12  26.19 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  30.3 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  35.09 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  32.19 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  20.78 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  39.5 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  28.99 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 250 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  25.88 
 
 		 275 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  23.9 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 245 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  31.06 
 
 		 257 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  25.57 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  31.54 
 
 		 250 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  28.7 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.83 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  24.31 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 250 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  30.61 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  28.43 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.08 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.08 
 
 		 256 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  23.92 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 259 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54050  hypothetical protein  35.42 
 
 		 221 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 246 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 253 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 242 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 278 aa  49.3  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  21.52 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  20.97 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  26.22 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  24.79 
 
 		 243 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.57 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.19 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  33 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.27 
 
 		 261 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  23.81 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.25 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  30.83 
 
 		 273 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  28.08 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 256 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.24 
 
 		 259 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  23.85 
 
 		 267 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.57 
 
 		 256 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  30.7 
 
 		 274 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 247 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  25.44 
 
 		 206 aa  46.2  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.57 
 
 		 256 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1987  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 335 aa  45.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.791499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  45.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.99 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0301  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  24.07 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  36.27 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  23.9 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  25.3 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.57 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.29 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 145 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  35.71 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  24.53 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  25.19 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 254 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 250 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>