More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4608 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  59.75 
 
 		 249 aa  265  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  55.1 
 
 		 249 aa  255  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  54.51 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  47.6 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.77 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  36.77 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.47 
 
 		 257 aa  131  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  34.51 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  35.62 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  33.94 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.88 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  33.03 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  31.8 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  30.88 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  30.88 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  38.14 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  30.69 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  29.7 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  26.75 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  26.75 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  26.75 
 
 		 256 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  27.59 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  26.75 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  27.19 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  26.75 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  33.64 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  36.92 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  29.03 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  32.29 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  32.29 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  37 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  32.63 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  32.29 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  32.63 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  31.65 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  22.85 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  32.63 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  32.63 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.46 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 1106 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  31.25 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  31.25 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  46.48 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.89 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  45.9 
 
 		 210 aa  52.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  43.94 
 
 		 262 aa  52  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.6 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  21.88 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  24.77 
 
 		 541 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  32.35 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  25.91 
 
 		 541 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  28.7 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.02 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.51 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  32 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>