More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0176 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 		 260 aa  544  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2600  Methyltransferase type 11  40.23 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528194  normal  0.130086 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1420  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 266 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1386  Methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0374  hypothetical protein  28.15 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297536  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2150  hypothetical protein  28.15 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0280  hypothetical protein  28.15 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554793  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1875  hypothetical protein  28.15 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1729  hypothetical protein  28.15 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0334  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.530164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1721  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1172  hypothetical protein  28.15 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0885  hypothetical protein  28.15 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2515  putative SAM-dependent methyltransferase, SmtA  31 
 
 		 277 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  40.77 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  34.75 
 
 		 638 aa  69.7  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  41.35 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  40 
 
 		 362 aa  62  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.53 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.13 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.03 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.59 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  36.52 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  31.3 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 1106 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.34 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  27.85 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.93 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  28.76 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.81 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  29.38 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.29 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  33.93 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  29.17 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 2490 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6864  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.29 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  28.8 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  27.59 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20833  predicted protein  33.04 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.11 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 209 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.97 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.35 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  30.23 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.68 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.92 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>