More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0991 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  100 
 
 
225 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  43.13 
 
 
218 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  40.76 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  27.36 
 
 
190 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  47.79 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
319 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  37.17 
 
 
200 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  38.79 
 
 
272 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.4 
 
 
330 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
300 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  38.21 
 
 
200 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.37 
 
 
302 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  42.19 
 
 
245 aa  58.9  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.9 
 
 
291 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.69 
 
 
300 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 
252 aa  58.2  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.69 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.69 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.69 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 
634 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.69 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  42.72 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.69 
 
 
300 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.69 
 
 
300 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.69 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.69 
 
 
300 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.69 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  32.79 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  33.71 
 
 
310 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  33.79 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.41 
 
 
255 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.01 
 
 
300 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  36.27 
 
 
246 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.27 
 
 
246 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.27 
 
 
246 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
317 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  35.09 
 
 
285 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  33.1 
 
 
272 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  45 
 
 
251 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  37.93 
 
 
272 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3731  Methyltransferase type 11  32 
 
 
298 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
197 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
274 aa  55.1  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.01 
 
 
300 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
225 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6864  Methyltransferase type 11  26.18 
 
 
307 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
218 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  29.27 
 
 
290 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  36.11 
 
 
267 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  33.33 
 
 
311 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.58 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.01 
 
 
300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  43.14 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  28.33 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  41.75 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.39 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.11 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.03 
 
 
300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.82 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
328 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  35.45 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.78 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  35.34 
 
 
201 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  38 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
266 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  32.73 
 
 
400 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  33.81 
 
 
392 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  35.34 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  35.34 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
257 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  33.33 
 
 
311 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  35.34 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  35.34 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  35.34 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  38.39 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  39.18 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 
457 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
307 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  33.02 
 
 
248 aa  52.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
207 aa  52.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  37.29 
 
 
310 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.01 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
300 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.26 
 
 
253 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 
271 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>