More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3259 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  511  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  24.69 
 
 
244 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 
276 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  25.54 
 
 
273 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  23.81 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  22.98 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 
624 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1110  hypothetical protein  22.5 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  24.72 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  19.25 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  26.06 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  22.42 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0557  Methyltransferase type 11  28.08 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.68 
 
 
213 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  18.43 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0176  hypothetical protein  22.22 
 
 
279 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261727  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 
328 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.11 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 
236 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  27.46 
 
 
310 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.95 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  31.15 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.55 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.93 
 
 
277 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.97 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.25 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  27.01 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  29.13 
 
 
355 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  24.35 
 
 
272 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  18.5 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.62 
 
 
205 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  29.71 
 
 
392 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
273 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  30 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.03 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  25.76 
 
 
259 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.24 
 
 
280 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  27.46 
 
 
311 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  25 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.4 
 
 
277 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
265 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  28.16 
 
 
328 aa  59.3  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0894  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.66 
 
 
235 aa  58.9  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000138444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  31.21 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.82 
 
 
283 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 
240 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
415 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
282 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  23.24 
 
 
237 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
303 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  30.63 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.97 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.09 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.81 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 
457 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  28.46 
 
 
213 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  37.27 
 
 
293 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.1 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.78 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.77 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  29.11 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  25.69 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
298 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  25.75 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
275 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  26.39 
 
 
339 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.2 
 
 
200 aa  56.6  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.84 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  29.17 
 
 
311 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  30 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  29.17 
 
 
311 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  25.22 
 
 
275 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  25.42 
 
 
268 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  25.42 
 
 
268 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.09 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
285 aa  56.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.58 
 
 
232 aa  55.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.32 
 
 
271 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
278 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
231 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.9 
 
 
280 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 
273 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.91 
 
 
346 aa  55.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>