More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0189 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 
275 aa  555  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.5 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  28.16 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  22.93 
 
 
237 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
269 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
239 aa  63.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  27.04 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
250 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
885 aa  62.4  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  30.22 
 
 
261 aa  62.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  25.53 
 
 
249 aa  62.4  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.33 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  26.13 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  22.44 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  24.62 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  27.13 
 
 
290 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
239 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
238 aa  59.3  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  30.77 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.16 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  30.89 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.82 
 
 
232 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.57 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 
235 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
339 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  23.13 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
204 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  27.07 
 
 
243 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.92 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  27.07 
 
 
243 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
204 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
204 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  27.07 
 
 
243 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
187 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  30.33 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.3 
 
 
258 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  27.82 
 
 
231 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.57 
 
 
213 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
254 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
239 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  28.15 
 
 
258 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
241 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  26.23 
 
 
241 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  29.63 
 
 
400 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.73 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  23.85 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  27.42 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  25.42 
 
 
225 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1044  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
228 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.87 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  20.99 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  23.95 
 
 
241 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.5 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  25.95 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0929  methyltransferase type 11  30 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  23.03 
 
 
288 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  27.4 
 
 
194 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
2490 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
711 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
710 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  24.58 
 
 
237 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
354 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.25 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  22.45 
 
 
247 aa  53.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
246 aa  53.1  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  25.41 
 
 
202 aa  53.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  29.36 
 
 
205 aa  52.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 
194 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  22.05 
 
 
281 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  25.62 
 
 
237 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  24.78 
 
 
244 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  22.57 
 
 
275 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  24.17 
 
 
222 aa  52.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.79 
 
 
237 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.96 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
272 aa  52.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  32.23 
 
 
272 aa  52.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.79 
 
 
345 aa  52.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
276 aa  52.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.96 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.96 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.96 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.96 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>