More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1619 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  100 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  24.69 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  31.73 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  28.88 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0557  Methyltransferase type 11  33.47 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.46 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  29.61 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.07 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  25.96 
 
 		 273 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1110  hypothetical protein  24.49 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  39 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  39 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 409 aa  58.9  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  38 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3318  hypothetical protein  33.11 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 271 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.74 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  31.43 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2733  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 506 aa  55.1  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122913  normal  0.460433 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  25.52 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.38 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.38 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  38.05 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  38.54 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.85 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  41.24 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.29 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 307 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.07 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 295 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  35.96 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.96 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.11 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 411 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 267 aa  52  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  29.31 
 
 		 309 aa  52  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.87 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 		 355 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.79 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 810 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 298 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2179  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  33.98 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.9 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.08 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.82 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  32.54 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  33.68 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>