More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2836 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  100 
 
 
234 aa  474  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  34.74 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5480  methyltransferase type 12  39.68 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7379  SAM-dependent methyltransferase  30.3 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0789  methyltransferase type 11  37.84 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
225 aa  62.4  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  34.09 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4435  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.17 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.39 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  31.46 
 
 
233 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
265 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
248 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
262 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.33 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 
305 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  34.29 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  35.24 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  32.08 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  39.77 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  29.92 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
634 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  34.51 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  31.3 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
263 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  33.68 
 
 
216 aa  55.5  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
283 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
266 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  33.58 
 
 
274 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
271 aa  55.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
279 aa  55.1  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
252 aa  55.1  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  31.36 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  28.03 
 
 
279 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
362 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  34 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0899  methyltransferase  32.32 
 
 
328 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
188 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  37.38 
 
 
282 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  32.04 
 
 
256 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  30.95 
 
 
309 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  30.48 
 
 
258 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
382 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
309 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1055  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2351  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
270 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
242 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
242 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
284 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  27.68 
 
 
283 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  38 
 
 
291 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  27.68 
 
 
252 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
268 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  27.68 
 
 
242 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  32.82 
 
 
291 aa  52  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  27.68 
 
 
242 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  27.68 
 
 
242 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  27.68 
 
 
252 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  32.33 
 
 
259 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  27.68 
 
 
242 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
204 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  37.89 
 
 
197 aa  52  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
256 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.73 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
276 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  26.55 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  36.84 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  35 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.86 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  35.23 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.44 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  33.09 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  27 
 
 
377 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  27.01 
 
 
276 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
286 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3236  methyltransferase type 11  39.71 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>