More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3996 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  100 
 
 
289 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  40.6 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 
187 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0692  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 
205 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.96 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  29.95 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0691  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
205 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  31.46 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
221 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  28.25 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
245 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  30.87 
 
 
235 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 
234 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0657  methyltransferase type 11  40.95 
 
 
205 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  29.55 
 
 
246 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
305 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  33.61 
 
 
245 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  30.46 
 
 
268 aa  62.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.52 
 
 
283 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.81 
 
 
251 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  28 
 
 
272 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.81 
 
 
251 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  35.58 
 
 
261 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.41 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  38.53 
 
 
233 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.52 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.52 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  29.88 
 
 
202 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.81 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.41 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.41 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.41 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  39.64 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.41 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  33.04 
 
 
352 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.41 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.61 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.375212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.41 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
367 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.09 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.09 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.09 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.9 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.86 
 
 
251 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07191  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.23 
 
 
227 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.0203679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.09 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
216 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  29.35 
 
 
223 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.29 
 
 
205 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.8 
 
 
239 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
274 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14181  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.36 
 
 
226 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.71 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.61 
 
 
318 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.58 
 
 
237 aa  59.7  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.71 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.21 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.74 
 
 
241 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0094  SAM-dependent methyltransferase  24.56 
 
 
227 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333279  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.24 
 
 
246 aa  59.3  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  30.56 
 
 
218 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
330 aa  59.3  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  34.97 
 
 
256 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  32.41 
 
 
235 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  40.59 
 
 
254 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.48 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  36.45 
 
 
357 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  38.05 
 
 
213 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  40.59 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.7 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  29.55 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
220 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.58 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 
267 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  36.59 
 
 
364 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.58 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.23 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  23.67 
 
 
411 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  30.33 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  36.94 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>