147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0094 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0094  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
227 aa  473  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333279  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07191  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  98.24 
 
 
227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.0203679 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  47.6 
 
 
231 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795739 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14181  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.07 
 
 
226 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  41.33 
 
 
223 aa  175  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07351  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.36 
 
 
231 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.138217  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07171  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.74 
 
 
231 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07151  methylase  38.86 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353179  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0662  hypothetical protein  39.39 
 
 
231 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  37.33 
 
 
226 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1655  methyltransferase type 12  35.68 
 
 
222 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.159478  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  34.07 
 
 
223 aa  141  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  34.67 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0120  Methyltransferase type 12  34.07 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  31.86 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.58 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.04 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.75 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  24.56 
 
 
289 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  33.68 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  28.57 
 
 
307 aa  55.8  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.58 
 
 
256 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.83 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
257 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  21.86 
 
 
240 aa  52.4  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  25.78 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  29.27 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.25 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.91 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  35 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.79 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  28.4 
 
 
344 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.75 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 
312 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.81 
 
 
255 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.78 
 
 
256 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  32 
 
 
263 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 
261 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 
265 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.85 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  25.16 
 
 
307 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
243 aa  48.5  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.65 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  24.18 
 
 
305 aa  48.5  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  23.66 
 
 
240 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0877  hypothetical protein  26.89 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578473  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.5 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  28.05 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  34.65 
 
 
273 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  33.75 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  33.75 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  33.75 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.88 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.03 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.58 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.77 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  26.52 
 
 
258 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  30.69 
 
 
305 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.37 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
323 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  30.33 
 
 
395 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.58 
 
 
258 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  23.08 
 
 
307 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.58 
 
 
258 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.58 
 
 
258 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2001  methyltransferase type 11  24.2 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323981  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  21.95 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31370  hypothetical protein  43.59 
 
 
275 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14144  hitchhiker  0.000000000000010613 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.17 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  22.98 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  29.35 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  40 
 
 
267 aa  45.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.4 
 
 
268 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  26.14 
 
 
275 aa  45.1  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  43.59 
 
 
275 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.05 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.65 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.65 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.65 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  23.14 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.75 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.65 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.04 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.04 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  34.04 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.7 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.9 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.71 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.04 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>