112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14181 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_14181  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
226 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  48.67 
 
 
231 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795739 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0094  SAM-dependent methyltransferase  41.07 
 
 
227 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333279  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07191  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.62 
 
 
227 aa  184  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.0203679 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  45.09 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  45.58 
 
 
223 aa  180  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07151  methylase  39.04 
 
 
235 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353179  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07171  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.12 
 
 
231 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07351  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.05 
 
 
231 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.138217  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0662  hypothetical protein  37.28 
 
 
231 aa  157  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  42.11 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0120  Methyltransferase type 12  39.11 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  40 
 
 
223 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1655  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.159478  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  39.3 
 
 
220 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.89 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  29.36 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.5 
 
 
257 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.93 
 
 
255 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  29.19 
 
 
307 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.64 
 
 
256 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  30.19 
 
 
285 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.62 
 
 
258 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  41.54 
 
 
253 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.62 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.62 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0640  Trans-aconitate 2-methyltransferase  38.71 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.93 
 
 
259 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  28.21 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.08 
 
 
256 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.15 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  28 
 
 
310 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  24.82 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  24.82 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  45.83 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.11 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  25.53 
 
 
269 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  25.53 
 
 
269 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  25.53 
 
 
269 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.46 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  25.53 
 
 
269 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.24 
 
 
293 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  25.53 
 
 
269 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  33.33 
 
 
258 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  46 
 
 
268 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  31.67 
 
 
307 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.91 
 
 
256 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.09 
 
 
237 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 
253 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  24.69 
 
 
248 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.09 
 
 
237 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.02 
 
 
287 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.14 
 
 
254 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.97 
 
 
258 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.57 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  25 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.57 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.29 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
305 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  26.42 
 
 
269 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.32 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  26.95 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
309 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  26.42 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.34 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  31.13 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.51 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.97 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
323 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.51 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.7 
 
 
262 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  41.07 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 
333 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  24.72 
 
 
411 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.82 
 
 
262 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
307 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
259 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
244 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 
260 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.58 
 
 
272 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  28.7 
 
 
405 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.38 
 
 
269 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.51 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
200 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  45 
 
 
256 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.51 
 
 
253 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  31.93 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.58 
 
 
258 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  26.06 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
200 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.3 
 
 
254 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.67 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>