More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0729 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  85.78 
 
 		 235 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  76.19 
 
 		 245 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  62.98 
 
 		 234 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  54.98 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0820  methyltransferase type 11  55.05 
 
 		 226 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191685  normal  0.813143 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  49.78 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  50.24 
 
 		 220 aa  208  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  52.2 
 
 		 216 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  51.43 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  52.15 
 
 		 224 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  50.97 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  50.49 
 
 		 210 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  49.06 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2916  O-methyltransferase  49.28 
 
 		 206 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  37.33 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  27.33 
 
 		 907 aa  66.2  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.43 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.16 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  29.55 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  30 
 
 		 228 aa  62  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  30.67 
 
 		 771 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.57 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.76 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.87 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.88 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2716  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.14 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.87 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.61 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.26 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  30.61 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42872  predicted protein  31.06 
 
 		 808 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 337 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  26.54 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.82 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.62 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.4 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.77 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.48 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.03 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  31.88 
 
 		 341 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.79 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  24.29 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  23.3 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  25.63 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.88 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 340 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.72 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 341 aa  52.8  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 341 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 337 aa  52.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  32.46 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.14 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.11 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.11 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  32.98 
 
 		 518 aa  52.4  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  30.1 
 
 		 542 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.21 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0954  methyltransferase type 12  26.83 
 
 		 343 aa  52  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.22 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1240  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.15 
 
 		 362 aa  52  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0688232  normal  0.839739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  31.19 
 
 		 2082 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 195 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4840  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.5 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35.78 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0992  methyltransferase type 12  26.83 
 
 		 360 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.67 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  30.65 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.48 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  25.64 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.82 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>