40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42872 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42872  predicted protein  100 
 
 
808 aa  1687    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  27.96 
 
 
907 aa  208  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0043  hypothetical protein  27.09 
 
 
400 aa  116  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.303817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0224  hypothetical protein  27.4 
 
 
441 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  27.32 
 
 
771 aa  105  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2515  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  26.29 
 
 
414 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0856  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  25.33 
 
 
416 aa  97.8  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01970  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 
797 aa  93.6  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.790317  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2613  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase protein  24.73 
 
 
414 aa  90.9  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893185  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3049  hypothetical protein  25.93 
 
 
419 aa  90.9  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05914  conserved hypothetical protein  25.98 
 
 
790 aa  90.1  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1274  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  25.41 
 
 
401 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83535  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2873  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase protein  24.72 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3617  hypothetical protein  24.04 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.170056  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2110  hypothetical protein  27.08 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0819  hypothetical protein  26.25 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.93853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0798  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  23.94 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  24.42 
 
 
238 aa  80.5  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0728  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  23.48 
 
 
406 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2021  hypothetical protein  24.52 
 
 
415 aa  79  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1728  hypothetical protein  24.14 
 
 
411 aa  77  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0627  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  24 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2914  hypothetical protein  23.55 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  32.97 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  31.85 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
224 aa  67.4  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
224 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
224 aa  62.4  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  32.1 
 
 
230 aa  61.6  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1950  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3- carboxypropyl transferase-like protein  28.1 
 
 
366 aa  56.6  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  31.06 
 
 
246 aa  57  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2916  O-methyltransferase  30.57 
 
 
206 aa  55.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
220 aa  55.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  28.42 
 
 
235 aa  54.3  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  29.19 
 
 
210 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
210 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0820  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
226 aa  52  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191685  normal  0.813143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  29.01 
 
 
245 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  27.98 
 
 
234 aa  51.2  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  32.94 
 
 
352 aa  44.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>