More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2874 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  100 
 
 
224 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  93.75 
 
 
224 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2916  O-methyltransferase  62.69 
 
 
206 aa  270  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  60.49 
 
 
224 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  55.81 
 
 
220 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0820  methyltransferase type 11  54.59 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191685  normal  0.813143 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  53.7 
 
 
230 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  52.56 
 
 
234 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  50.75 
 
 
210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  52.15 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  50.25 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  47.17 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  52.68 
 
 
235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  50.72 
 
 
245 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  51.11 
 
 
216 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  30.77 
 
 
771 aa  74.7  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  29.88 
 
 
907 aa  70.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.75 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.46 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.56 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.17 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.67 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.75 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.17 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.75 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42872  predicted protein  28.57 
 
 
808 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.28 
 
 
215 aa  62.4  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.96 
 
 
213 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.09 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  30 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.97 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.54 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.93 
 
 
217 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
228 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.34 
 
 
209 aa  58.2  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
212 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.94 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1441  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.43 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000764793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  30 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5117  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.013812  hitchhiker  0.00397391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  26.71 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.36 
 
 
204 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  24.46 
 
 
213 aa  55.1  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  26.04 
 
 
235 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  31.78 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.77 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.77 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.74 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.38 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  28.24 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.58 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.31 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
261 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.92 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.58 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  36.92 
 
 
319 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.33 
 
 
234 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.73 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  30.25 
 
 
261 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.5 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.45 
 
 
237 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
317 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  35.04 
 
 
273 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
268 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  27.5 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.76 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2428  methyltransferase type 12  31.06 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.3 
 
 
206 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  30.09 
 
 
240 aa  52  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.83 
 
 
237 aa  52  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
204 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.7 
 
 
236 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3036  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  26.52 
 
 
229 aa  52  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133888  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.8 
 
 
237 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1708  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
187 aa  52  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0694395  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.45 
 
 
237 aa  51.6  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.45 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.45 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.45 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.95 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  26.17 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2716  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.45 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.08 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>