More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1275 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  65.07 
 
 		 235 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  66.37 
 
 		 245 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  62.98 
 
 		 246 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  54.76 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  50.93 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  52.56 
 
 		 224 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0820  methyltransferase type 11  50.93 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191685  normal  0.813143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  50.98 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  52.76 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  52.45 
 
 		 216 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  49.3 
 
 		 210 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  49.3 
 
 		 210 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  49.52 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2916  O-methyltransferase  49.28 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  28.99 
 
 		 907 aa  72.4  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.21 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.66 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21.28 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  29.93 
 
 		 399 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.92 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.83 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  34.17 
 
 		 328 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 327 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.08 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  26.98 
 
 		 542 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.52 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0146  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.844636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  33.9 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  32.2 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.34 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.24 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.08 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  27.75 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  28.81 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  31.86 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 279 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.7 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  30.09 
 
 		 414 aa  52.4  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  25.95 
 
 		 353 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 263 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2798  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.59 
 
 		 204 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 284 aa  52  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  31.43 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  25 
 
 		 518 aa  51.2  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  30 
 
 		 344 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42872  predicted protein  27.98 
 
 		 808 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2716  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182754  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  27.33 
 
 		 771 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.13 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.45 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.57 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  26.88 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  31.96 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  32.26 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.85 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2710  demethylmenaquinone methyltransferase  25.15 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  27.78 
 
 		 395 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  22.79 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  27.33 
 
 		 399 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02165  TAM domain methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15860)  31.36 
 
 		 373 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475648  normal  0.123223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  30 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  37.08 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  28.17 
 
 		 307 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.14 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 403 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  24.11 
 
 		 494 aa  50.1  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.52 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.15 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>