23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2110 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2110  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  860    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251663 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2613  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase protein  69.47 
 
 		 414 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893185  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2873  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase protein  68.51 
 
 		 414 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_2914  hypothetical protein  67.79 
 
 		 415 aa  588  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_2021  hypothetical protein  61.69 
 
 		 415 aa  521  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1728  hypothetical protein  58 
 
 		 411 aa  474  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0819  hypothetical protein  53.6 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.93853 
 
 
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NC_010581  Bind_3049  hypothetical protein  50.25 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2515  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  50 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_0856  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  50 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3617  hypothetical protein  49.38 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.170056  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_0224  hypothetical protein  42.86 
 
 		 441 aa  332  7.000000000000001e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_1274  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  41.21 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83535  normal  0.943861 
 
 
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NC_007958  RPD_0627  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  40.5 
 
 		 407 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_0728  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  40.6 
 
 		 406 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0798  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  39.75 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0043  hypothetical protein  29.31 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.303817  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_1950  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3- carboxypropyl transferase-like protein  24.15 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  26.52 
 
 		 907 aa  86.7  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011669  PHATRDRAFT_42872  predicted protein  27.08 
 
 		 808 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006687  CNE01970  conserved hypothetical protein  25.97 
 
 		 797 aa  84.3  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.790317  n/a   
 
 
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NC_009046  PICST_32640  predicted protein  23.03 
 
 		 771 aa  74.3  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal  1 
 
 
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BN001301  ANIA_05914  conserved hypothetical protein  23.99 
 
 		 790 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
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