48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32640 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  100 
 
 
771 aa  1612    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05914  conserved hypothetical protein  43.49 
 
 
790 aa  620  1e-176  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01970  conserved hypothetical protein  36.46 
 
 
797 aa  479  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.790317  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
238 aa  150  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0043  hypothetical protein  29.03 
 
 
400 aa  138  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.303817  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  28.57 
 
 
907 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42872  predicted protein  27.32 
 
 
808 aa  105  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0627  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  28.61 
 
 
407 aa  101  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0728  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  27.3 
 
 
406 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2914  hypothetical protein  26.51 
 
 
415 aa  97.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1274  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  27.32 
 
 
401 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83535  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0856  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  23.8 
 
 
416 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2613  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase protein  26.51 
 
 
414 aa  94  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893185  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2873  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase protein  25.14 
 
 
414 aa  94  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2515  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  24.16 
 
 
414 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0819  hypothetical protein  26.96 
 
 
426 aa  91.7  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.93853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0798  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  27.16 
 
 
407 aa  91.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2021  hypothetical protein  23.73 
 
 
415 aa  82  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1728  hypothetical protein  24.43 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0224  hypothetical protein  21.67 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
224 aa  77  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3049  hypothetical protein  23.45 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2110  hypothetical protein  23.03 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2916  O-methyltransferase  32.47 
 
 
206 aa  69.3  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3617  hypothetical protein  24.91 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.170056  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  30.13 
 
 
216 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  30.48 
 
 
245 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  30.3 
 
 
230 aa  64.7  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1950  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3- carboxypropyl transferase-like protein  34.15 
 
 
366 aa  62  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  30.67 
 
 
246 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  29.38 
 
 
235 aa  61.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 
231 aa  61.2  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0820  methyltransferase type 11  30.86 
 
 
226 aa  60.8  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191685  normal  0.813143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  27.95 
 
 
224 aa  59.7  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  25.11 
 
 
220 aa  57.4  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  29.52 
 
 
210 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  28.92 
 
 
210 aa  54.3  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  27.33 
 
 
234 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
330 aa  48.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0369  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.53 
 
 
235 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0467778  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1638  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.9 
 
 
235 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0346  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.53 
 
 
235 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.423606  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
245 aa  46.6  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0350  Methyltransferase type 11  23.73 
 
 
254 aa  45.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0118067  normal  0.408422 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
317 aa  45.4  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 
457 aa  45.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>