24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2914 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2914  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  860    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2613  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase protein  70.6 
 
 		 414 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2873  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase protein  70.6 
 
 		 414 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2110  hypothetical protein  67.79 
 
 		 420 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2021  hypothetical protein  60.14 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1728  hypothetical protein  55.67 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0819  hypothetical protein  48.8 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.93853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3049  hypothetical protein  49.26 
 
 		 419 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2515  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  49.5 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0856  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  49.5 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3617  hypothetical protein  48.25 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.170056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0224  hypothetical protein  43.61 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1274  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  40.47 
 
 		 401 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83535  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0627  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  39.45 
 
 		 407 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0728  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  38.9 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0798  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  38.4 
 
 		 407 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0043  hypothetical protein  29.5 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.303817  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  26.55 
 
 		 907 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  26.51 
 
 		 771 aa  97.1  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1950  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3- carboxypropyl transferase-like protein  24.93 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01970  conserved hypothetical protein  22.7 
 
 		 797 aa  80.1  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.790317  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05914  conserved hypothetical protein  23.33 
 
 		 790 aa  77.4  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42872  predicted protein  23.55 
 
 		 808 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3739  hypothetical protein  21.57 
 
 		 359 aa  50.1  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>