23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0728 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0798  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  88.42 
 
 
407 aa  717    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0728  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  100 
 
 
406 aa  823    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1274  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  77.31 
 
 
401 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83535  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0627  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  93.1 
 
 
407 aa  747    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2515  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  44.44 
 
 
414 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0224  hypothetical protein  40.59 
 
 
441 aa  311  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3049  hypothetical protein  44 
 
 
419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0856  S-adenosylmethionine-diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase  43.97 
 
 
416 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1728  hypothetical protein  43.73 
 
 
411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2021  hypothetical protein  42.43 
 
 
415 aa  302  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0819  hypothetical protein  41.96 
 
 
426 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.93853 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3617  hypothetical protein  42.96 
 
 
416 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.170056  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2914  hypothetical protein  38.9 
 
 
415 aa  276  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2110  hypothetical protein  40.6 
 
 
420 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2613  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase protein  39.1 
 
 
414 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893185  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2873  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase protein  39.1 
 
 
414 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0043  hypothetical protein  32.09 
 
 
400 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.303817  n/a   
 
 
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NC_009046  PICST_32640  predicted protein  27.3 
 
 
771 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal 
 
 
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NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  27.6 
 
 
907 aa  103  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
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NC_011669  PHATRDRAFT_42872  predicted protein  23.67 
 
 
808 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
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NC_006687  CNE01970  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 
797 aa  90.1  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.790317  n/a   
 
 
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BN001301  ANIA_05914  conserved hypothetical protein  25.07 
 
 
790 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
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NC_013517  Sterm_1950  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3- carboxypropyl transferase-like protein  34.82 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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