More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3050 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  100 
 
 
224 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  54.76 
 
 
230 aa  234  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  54.76 
 
 
234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  54.98 
 
 
246 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  55.71 
 
 
235 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  52.86 
 
 
245 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  49.52 
 
 
220 aa  209  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  52.13 
 
 
216 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0820  methyltransferase type 11  51.43 
 
 
226 aa  203  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191685  normal  0.813143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2916  O-methyltransferase  48.33 
 
 
206 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  47.17 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  47.17 
 
 
224 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  56.11 
 
 
210 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  55.56 
 
 
210 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  46.7 
 
 
224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42872  predicted protein  31.85 
 
 
808 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  25.6 
 
 
907 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.4 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.04 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  27.95 
 
 
771 aa  59.7  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.17 
 
 
245 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  34.83 
 
 
419 aa  58.5  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
268 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
195 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  30.19 
 
 
535 aa  55.5  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.6 
 
 
237 aa  55.5  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05914  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 
790 aa  55.1  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.48 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.66 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.37 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
337 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.64 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  28.99 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  38.24 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.26 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.68 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  28 
 
 
232 aa  52  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.48 
 
 
204 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3368  2-polyprenylmethoxybenozoquinol methylase  29.27 
 
 
250 aa  51.6  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
268 aa  51.6  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.67 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  29.84 
 
 
523 aa  51.2  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
327 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  35.04 
 
 
328 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  31.93 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  28.48 
 
 
542 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.6 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  35.51 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.09 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1338  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.6 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2593  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.6 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00547032  decreased coverage  0.0000000226487 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.45 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.04 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.03 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  32.76 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  27.54 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  28.81 
 
 
268 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4511  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.79 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.89 
 
 
253 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0766  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase protein  38.96 
 
 
406 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.159603 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  27.69 
 
 
518 aa  48.9  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  27.27 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30 
 
 
212 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.62 
 
 
229 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  32 
 
 
261 aa  48.5  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.79 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  35.37 
 
 
224 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  30.38 
 
 
186 aa  48.5  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 
212 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  28.32 
 
 
360 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.7 
 
 
244 aa  48.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01970  conserved hypothetical protein  26.5 
 
 
797 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.790317  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1536  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  31.5 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.445519  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.08 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  29.21 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.13 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.43 
 
 
283 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>