More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0857 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  100 
 
 
210 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  99.05 
 
 
210 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  74.76 
 
 
216 aa  296  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  52.86 
 
 
224 aa  208  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  50.75 
 
 
224 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  49.75 
 
 
224 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0820  methyltransferase type 11  52.61 
 
 
226 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191685  normal  0.813143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  49.3 
 
 
234 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  51.22 
 
 
220 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  50.49 
 
 
246 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  55.56 
 
 
224 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  50.49 
 
 
235 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2916  O-methyltransferase  49.24 
 
 
206 aa  181  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  49.03 
 
 
245 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  47.12 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  35.33 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.63 
 
 
269 aa  72  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.59 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  40.34 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  41.23 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
273 aa  62.8  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.72 
 
 
217 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.52 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
200 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
200 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2593  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.54 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00547032  decreased coverage  0.0000000226487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1338  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.54 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
278 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.58 
 
 
229 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.54 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.75 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  35.67 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 
299 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  36.75 
 
 
268 aa  58.9  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  28.57 
 
 
907 aa  58.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.06 
 
 
252 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
327 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
252 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3054  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 
236 aa  58.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10568  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.77 
 
 
234 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0587656  normal  0.225311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  39.05 
 
 
213 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.3 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.13 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  38.79 
 
 
328 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 
250 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
281 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.05 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0403  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.33 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0374  demethylmenaquinone methyltransferase  34.33 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.33 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  36.18 
 
 
365 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  34.42 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.35 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  32.9 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.4 
 
 
258 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.37 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.79 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.83 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
349 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  41.07 
 
 
354 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.64 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  29.52 
 
 
771 aa  55.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  41.07 
 
 
342 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.04 
 
 
235 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.29 
 
 
199 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
363 aa  55.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  26.71 
 
 
220 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
335 aa  55.1  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4209  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  27.93 
 
 
248 aa  55.1  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.26 
 
 
245 aa  54.7  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.9 
 
 
257 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.66 
 
 
232 aa  54.7  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.6 
 
 
241 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  39.2 
 
 
319 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
217 aa  54.7  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.6 
 
 
241 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.89 
 
 
237 aa  54.7  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.26 
 
 
207 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0278  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.91 
 
 
251 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.831577  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4204  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.82 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
339 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  43.81 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.75 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  30.13 
 
 
629 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>