More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2714 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 274 aa  542  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  31.56 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.94 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  31.35 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  32.96 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.04 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2851  hypothetical protein  23.65 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0952286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  28.82 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  36.36 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  38.68 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  33.93 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  37.6 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  38.68 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  32.74 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  37.25 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.45 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.37 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.45 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  39.22 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  35.48 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.19 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  40.57 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  38.18 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  32.75 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  32.3 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  29.36 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 400 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  27.93 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  35 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  31.07 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.99 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.82 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  37.72 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.61 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  27.18 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  27.38 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  31.06 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.11 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 711 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  35.85 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.29 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  32.09 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 710 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.51 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.42 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  31.67 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  39.42 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  39.42 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  39.42 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  39.42 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  33.65 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  25.36 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  39.42 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  39.42 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  39.42 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.68 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  38.53 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  25.58 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  27.83 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  32.11 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1423  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  30.33 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>