More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2195 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  808    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  79.69 
 
 
398 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  62.03 
 
 
407 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  43.72 
 
 
399 aa  325  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  47.74 
 
 
414 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  44.42 
 
 
403 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  44.5 
 
 
399 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  43.54 
 
 
395 aa  302  6.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  43.88 
 
 
400 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  43.62 
 
 
400 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  46.07 
 
 
390 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  31.31 
 
 
402 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.25 
 
 
402 aa  122  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  31.88 
 
 
434 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  32.22 
 
 
441 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  33.47 
 
 
360 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  28.14 
 
 
441 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  28.14 
 
 
441 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  34.67 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  26.69 
 
 
440 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  30.17 
 
 
360 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  27.31 
 
 
370 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  26.89 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  27.51 
 
 
444 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  28.69 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  28.83 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.42 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
779 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  28.52 
 
 
359 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.47 
 
 
1676 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.77 
 
 
780 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  28.12 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  29.61 
 
 
653 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  25.93 
 
 
779 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.1 
 
 
865 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  25.5 
 
 
580 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  24.39 
 
 
704 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.62 
 
 
875 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  23.59 
 
 
631 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  36.89 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
274 aa  67  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
250 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
214 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  40 
 
 
241 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
276 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
661 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.05 
 
 
254 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  31.13 
 
 
252 aa  60.1  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
267 aa  60.1  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
270 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5458  methyltransferase type 12  32.5 
 
 
239 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112293  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34 
 
 
242 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.15 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
225 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  33.61 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  32.45 
 
 
268 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5079  methyltransferase type 12  33.13 
 
 
238 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  26.76 
 
 
211 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5167  methyltransferase type 12  33.13 
 
 
238 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
285 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
230 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
285 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  40.74 
 
 
285 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
285 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  29.6 
 
 
242 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
252 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.37 
 
 
263 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  30.47 
 
 
223 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.24 
 
 
237 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.82 
 
 
238 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  34.08 
 
 
273 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.56 
 
 
236 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
235 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.92 
 
 
237 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.74 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0492  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.09 
 
 
428 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.92 
 
 
237 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.36 
 
 
232 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  36 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  36 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  36 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  26.57 
 
 
542 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  36.43 
 
 
204 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  40 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
268 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.1 
 
 
246 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 
259 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
218 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  24.24 
 
 
241 aa  53.9  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
276 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
314 aa  53.5  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.45 
 
 
240 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  36.78 
 
 
226 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  33 
 
 
226 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 
245 aa  53.5  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  30 
 
 
229 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
209 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.63 
 
 
238 aa  53.1  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>