More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04751 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  100 
 
 
407 aa  830    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  62.03 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  63.04 
 
 
398 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  42.48 
 
 
403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  43.36 
 
 
399 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  45.59 
 
 
414 aa  315  9e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  43.78 
 
 
400 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  41.27 
 
 
399 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  42.58 
 
 
395 aa  308  8e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  42.72 
 
 
400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  44.23 
 
 
390 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  31.74 
 
 
402 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.75 
 
 
402 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
434 aa  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  31.55 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  30.36 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  30.36 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
439 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  30.69 
 
 
407 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  26.75 
 
 
440 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  31.54 
 
 
360 aa  96.3  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  27.31 
 
 
631 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  27.13 
 
 
653 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  28.51 
 
 
580 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 
444 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  27.07 
 
 
360 aa  92.8  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
370 aa  90.9  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  30.8 
 
 
359 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  31.76 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.83 
 
 
447 aa  88.2  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.11 
 
 
865 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
360 aa  84  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
779 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.72 
 
 
875 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  30.81 
 
 
1676 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  25.93 
 
 
779 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  25.36 
 
 
704 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  25.85 
 
 
780 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
274 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  35.58 
 
 
268 aa  63.2  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
252 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5167  methyltransferase type 12  38.39 
 
 
238 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5079  methyltransferase type 12  38.39 
 
 
238 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
211 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  39.83 
 
 
241 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 
661 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.17 
 
 
259 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  33.76 
 
 
223 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.37 
 
 
244 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.68 
 
 
234 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5458  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
239 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112293  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  28.71 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  31.75 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  31.75 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  31.75 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
225 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
250 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  27.92 
 
 
229 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.63 
 
 
242 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  33.02 
 
 
246 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  37.11 
 
 
276 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.98 
 
 
239 aa  56.6  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
268 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
270 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.19 
 
 
213 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  35.65 
 
 
242 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  36.61 
 
 
267 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  29.37 
 
 
235 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
259 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  40 
 
 
253 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.94 
 
 
236 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.01 
 
 
245 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  32.81 
 
 
223 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 
249 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.65 
 
 
237 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 
249 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.67 
 
 
264 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.29 
 
 
238 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.85 
 
 
254 aa  54.7  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.65 
 
 
237 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 
235 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
312 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  27.1 
 
 
236 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 
254 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 
238 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.91 
 
 
253 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
209 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.92 
 
 
471 aa  53.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  29.52 
 
 
314 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
209 aa  53.5  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  40.74 
 
 
223 aa  53.5  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2405  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.41 
 
 
236 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031453  unclonable  0.0000107222 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2288  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.41 
 
 
236 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2057  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.41 
 
 
236 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  unclonable  0.00000000000181282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2061  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.41 
 
 
236 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000216259  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.68 
 
 
263 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  26.45 
 
 
222 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
266 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>