More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00932 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  100 
 
 
261 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  100 
 
 
261 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  100 
 
 
261 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  99.62 
 
 
261 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  100 
 
 
261 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  100 
 
 
261 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  100 
 
 
261 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  100 
 
 
261 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  88.58 
 
 
267 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  88.58 
 
 
267 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  88.58 
 
 
267 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  88.19 
 
 
267 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  88.19 
 
 
267 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  76.86 
 
 
258 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  67.82 
 
 
261 aa  381  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  67.05 
 
 
261 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  66.14 
 
 
278 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  63.98 
 
 
261 aa  363  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  63.98 
 
 
261 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 
261 aa  361  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 
261 aa  358  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 
261 aa  353  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  49.61 
 
 
260 aa  274  9e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  46.77 
 
 
271 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  48.44 
 
 
263 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  48.05 
 
 
259 aa  264  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  46.88 
 
 
263 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  45.63 
 
 
262 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  45.63 
 
 
262 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  44.98 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  44.31 
 
 
257 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  46.4 
 
 
261 aa  242  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  44.31 
 
 
257 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  44.31 
 
 
257 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  43.92 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  45.85 
 
 
254 aa  238  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  44.88 
 
 
256 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  44.96 
 
 
256 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  43.78 
 
 
257 aa  234  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  40.08 
 
 
284 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  39.77 
 
 
259 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  40.71 
 
 
252 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  39.53 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  39.76 
 
 
249 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  39.92 
 
 
249 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  40.08 
 
 
249 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  39.06 
 
 
249 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  38.19 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  39.53 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  37.45 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  37.74 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  39.85 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  37.15 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  39.13 
 
 
249 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
295 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  37.55 
 
 
249 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  38.34 
 
 
249 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  35.36 
 
 
295 aa  162  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  36.87 
 
 
221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  34.83 
 
 
199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  32.77 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  29.67 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  30.61 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  28.98 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  28.99 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  29.53 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  24.37 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  27.17 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.76 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.03 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.65 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.42 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
274 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  36.67 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.37 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.29 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.53 
 
 
234 aa  58.9  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  31.07 
 
 
297 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  26.23 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.48 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
457 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.29 
 
 
232 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.19 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.65 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.77 
 
 
402 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>