More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2762 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  100 
 
 		 288 aa  568  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5566  methyltransferase type 12  44.57 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.509991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.08 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  38.19 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  39.48 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2851  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  36.33 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9102  hypothetical protein  36.73 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3689  Methyltransferase type 12  35.71 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00200869  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4137  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0760  methyltransferase type 11  33.47 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 853 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0702  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136876  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.79 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1840  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.51 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2754  Methyltransferase type 12  32.13 
 
 		 260 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  31.2 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38159  predicted protein  33.59 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  25.68 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  28.1 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  28.34 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2318  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  32.71 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.300919  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2807  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2726  putative methyltransferase  43.04 
 
 		 82 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.607127  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.94 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5826  methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.790939 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6585  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.19 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.92 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  35.61 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  26.1 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.07 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.73 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  40.82 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.03 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.33 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 996 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.04 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1240  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 		 362 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0688232  normal  0.839739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 224 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4840  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  33 
 
 		 266 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 196 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  24.89 
 
 		 274 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 270 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 205 aa  52.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.27 
 
 		 201 aa  52.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  28.46 
 
 		 524 aa  52.4  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 268 aa  52.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  31.4 
 
 		 208 aa  52.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.23 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.68 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  31.71 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  26.11 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.13 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  36.46 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  30.63 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  22.16 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  34.26 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.15 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  27.59 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.07 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  33.65 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 204 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4247  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.07 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>