More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04686 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 282 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  41.75 
 
 		 287 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 382 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  28.63 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 283 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 277 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.32 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  35.71 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  32.3 
 
 		 559 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  32.48 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.61 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.19 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.62 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  31.37 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  30.99 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  39.32 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  28.45 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  33.33 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  41.35 
 
 		 347 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  27.04 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  30.72 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  24.54 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  35.9 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  31.37 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  40.71 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.84 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  33.85 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.63 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  31.44 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  27.45 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 1012 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4511  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  40.71 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  34.55 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  31.4 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4089  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.85 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.13 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.2 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.95 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0081  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.24 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.56 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2907  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.61 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.02 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  29.26 
 
 		 526 aa  62.4  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 238 aa  62  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.03 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.11 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3658  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.62 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.70132e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>