More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0552 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 247 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  51.01 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  49.38 
 
 		 464 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  45.87 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  40.56 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  43.21 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  32.8 
 
 		 264 aa  156  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  29.64 
 
 		 250 aa  151  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  39.76 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  30.68 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  38.52 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 398 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  35.12 
 
 		 390 aa  141  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 390 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 391 aa  135  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 390 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  31.47 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.29 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  29.62 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  35.89 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 392 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 391 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  34.84 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  27.57 
 
 		 392 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  40.5 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.67 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  40.71 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 572 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  33.04 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.12 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  36.07 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.07 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.99 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  29.08 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.97 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.93 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  36.07 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.76 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 279 aa  62  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.93 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.79 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.93 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.28 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  28.4 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  34.55 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  40.38 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  43.1 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.03 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  34.68 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.61 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.11 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.23 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  30.5 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  38.1 
 
 		 776 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  27.78 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.21 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.71 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  27.78 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.71 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  26.35 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.43 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>