More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  69.43 
 
 		 572 aa  812    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  100 
 
 		 559 aa  1150    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  72.59 
 
 		 268 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  70.66 
 
 		 269 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  69.06 
 
 		 268 aa  398  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  67.8 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  68.3 
 
 		 272 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  62.83 
 
 		 278 aa  360  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  60.36 
 
 		 279 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  61.45 
 
 		 283 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  52.5 
 
 		 286 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  52.4 
 
 		 279 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  53.43 
 
 		 282 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  46.49 
 
 		 277 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  51.52 
 
 		 282 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  49.14 
 
 		 233 aa  239  8e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  48.54 
 
 		 258 aa  230  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 280 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  33.45 
 
 		 285 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10531  methyltransferase  53.98 
 
 		 116 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16375  predicted protein  33.33 
 
 		 279 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00657234  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 267 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 264 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 276 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.36 
 
 		 280 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  29.72 
 
 		 278 aa  95.9  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  27.75 
 
 		 342 aa  95.9  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 284 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 251 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  35.55 
 
 		 328 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 287 aa  90.5  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 283 aa  90.1  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 278 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  31.67 
 
 		 377 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 282 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 283 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  28.23 
 
 		 304 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  28.83 
 
 		 280 aa  87.8  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.23 
 
 		 305 aa  87.4  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  32.11 
 
 		 304 aa  87  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  31.77 
 
 		 271 aa  87  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 328 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 382 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  35 
 
 		 279 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.15 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  33.51 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  27.48 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.38 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  31.03 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  31.61 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  32.3 
 
 		 274 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 274 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  28.17 
 
 		 318 aa  82.8  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48704  predicted protein  29.46 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  30.69 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.57 
 
 		 310 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  30.56 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  30.23 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  25.57 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  34.29 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  24.04 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  24.04 
 
 		 387 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  30.46 
 
 		 317 aa  76.6  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  30.6 
 
 		 304 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 261 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  25.28 
 
 		 287 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  27.1 
 
 		 311 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  31.43 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  22.27 
 
 		 283 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  23.69 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  23.94 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  31.22 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  23.4 
 
 		 254 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 293 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 		 248 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 284 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.82 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  31.43 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 261 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  27.06 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  27.06 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  27.06 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.88 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.28 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  26.61 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  25.48 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  26.61 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 1012 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.41 
 
 		 282 aa  67  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>