148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1624 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 542 aa  1092    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  35.6 
 
 		 564 aa  293  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  34.58 
 
 		 535 aa  269  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  29.55 
 
 		 514 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  36.41 
 
 		 523 aa  263  6e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  36.25 
 
 		 509 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  40.33 
 
 		 518 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  38.92 
 
 		 508 aa  231  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  33.05 
 
 		 494 aa  230  4e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  33.21 
 
 		 535 aa  230  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  36.24 
 
 		 1143 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  33.08 
 
 		 535 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  31.76 
 
 		 1144 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  37.94 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  37.57 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 482 aa  196  9e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  28.43 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  36.28 
 
 		 419 aa  194  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  42.02 
 
 		 252 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  29.64 
 
 		 1116 aa  141  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  33.97 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  29.72 
 
 		 518 aa  101  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  25.16 
 
 		 510 aa  89.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  29.2 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  29.2 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  29.2 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  29.2 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  29.2 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  28.76 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  28.76 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  28.35 
 
 		 512 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  27.5 
 
 		 590 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  24.73 
 
 		 514 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  24.4 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  22.93 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  24.14 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  29.05 
 
 		 488 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  26.22 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  23.34 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  23.34 
 
 		 400 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  26.88 
 
 		 414 aa  57  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  23.95 
 
 		 390 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 268 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 268 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  25.74 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  24.79 
 
 		 359 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  26.57 
 
 		 400 aa  54.7  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  26.98 
 
 		 234 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 276 aa  53.9  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  37.89 
 
 		 230 aa  53.5  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 235 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  30.15 
 
 		 360 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  30.1 
 
 		 246 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  30.12 
 
 		 287 aa  52.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.78 
 
 		 447 aa  52  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 226 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  27.18 
 
 		 267 aa  51.2  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  27.05 
 
 		 268 aa  50.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  29.75 
 
 		 441 aa  50.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 234 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  28.48 
 
 		 224 aa  50.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  29.33 
 
 		 434 aa  50.4  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3461  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  22.55 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 209 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 250 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 204 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1504  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.69 
 
 		 409 aa  48.9  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.250201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 236 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 285 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  22.7 
 
 		 779 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 268 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  30 
 
 		 270 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5944  methyltransferase type 12  25.36 
 
 		 320 aa  48.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.79 
 
 		 420 aa  47.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0725  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.1 
 
 		 427 aa  47.4  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0644252  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  30.93 
 
 		 307 aa  47.4  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 268 aa  47.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  21.82 
 
 		 580 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0134  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.08 
 
 		 440 aa  47.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681884 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2517  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  40.62 
 
 		 314 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  22.66 
 
 		 440 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 779 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  24.12 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 220 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 366 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  24.76 
 
 		 407 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 224 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3390  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.94 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  30.63 
 
 		 245 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  31.36 
 
 		 1140 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0720096  normal  0.188853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.14 
 
 		 232 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  23.18 
 
 		 631 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  26.53 
 
 		 230 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.67 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  27.18 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>