185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1462 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 434 aa  903    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  39.95 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  36.53 
 
 		 441 aa  274  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  33.33 
 
 		 407 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  28.12 
 
 		 395 aa  113  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  30.63 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  27.13 
 
 		 399 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  31.88 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  26.93 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  31 
 
 		 398 aa  107  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  28.29 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  31.98 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  31.96 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  28.52 
 
 		 390 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.38 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 440 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 779 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  25.77 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  30.1 
 
 		 580 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  26.89 
 
 		 779 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  32 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.04 
 
 		 875 aa  84  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 661 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.46 
 
 		 865 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  26.57 
 
 		 780 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  28.63 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  29.03 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  27.41 
 
 		 631 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  28.79 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.75 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  25.97 
 
 		 653 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  27.27 
 
 		 704 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1676 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  28.11 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  28.3 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  35.14 
 
 		 256 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  35.1 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 278 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.95 
 
 		 261 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 261 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  26.95 
 
 		 261 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  26.95 
 
 		 261 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  26.95 
 
 		 261 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  26.95 
 
 		 261 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  26.95 
 
 		 261 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  26.95 
 
 		 261 aa  54.3  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  26.95 
 
 		 261 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 257 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  32.3 
 
 		 274 aa  53.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 257 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 262 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 262 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  30.09 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  31.53 
 
 		 256 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  34.58 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 257 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 268 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  24.57 
 
 		 258 aa  50.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  25.74 
 
 		 259 aa  50.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.48 
 
 		 239 aa  50.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  29.33 
 
 		 542 aa  50.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  28.85 
 
 		 907 aa  50.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 276 aa  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.13 
 
 		 248 aa  49.7  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  27.87 
 
 		 250 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  34.34 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  27.42 
 
 		 268 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.08 
 
 		 234 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  25.75 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 210 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  25.75 
 
 		 267 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  25.75 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  35 
 
 		 207 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.44 
 
 		 235 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  25.75 
 
 		 267 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  25.75 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.79 
 
 		 200 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.63 
 
 		 234 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 232 aa  47.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.81 
 
 		 238 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  29.57 
 
 		 284 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  34.78 
 
 		 236 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  35.96 
 
 		 222 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.72 
 
 		 283 aa  47  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.18 
 
 		 251 aa  47  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 		 240 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>