120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1668 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  100 
 
 		 535 aa  1080    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  77.9 
 
 		 535 aa  823    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  35.61 
 
 		 535 aa  297  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  34.1 
 
 		 509 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  32.37 
 
 		 542 aa  234  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  38.29 
 
 		 523 aa  223  7e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  38.29 
 
 		 518 aa  219  1e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  29.84 
 
 		 564 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  32.89 
 
 		 514 aa  208  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 494 aa  207  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  37.26 
 
 		 486 aa  207  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  35.26 
 
 		 508 aa  196  7e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  33.26 
 
 		 503 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  33.16 
 
 		 419 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  32.82 
 
 		 521 aa  171  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  43.48 
 
 		 252 aa  163  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  32.21 
 
 		 482 aa  157  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  30.45 
 
 		 1143 aa  147  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  28.24 
 
 		 1144 aa  126  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 499 aa  95.9  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  31.6 
 
 		 518 aa  91.7  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  30.87 
 
 		 499 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  30.87 
 
 		 499 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  30.87 
 
 		 499 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  30.87 
 
 		 499 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  30.87 
 
 		 499 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  30.43 
 
 		 499 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  30.43 
 
 		 499 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  26.41 
 
 		 1116 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  32.29 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  29.19 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  32.1 
 
 		 590 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  24.07 
 
 		 511 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  24.26 
 
 		 514 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  25 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.93 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 366 aa  54.3  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 268 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  31 
 
 		 344 aa  53.9  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  29.17 
 
 		 395 aa  53.9  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.92 
 
 		 346 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  27.27 
 
 		 631 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  26 
 
 		 205 aa  53.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1997  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.43 
 
 		 220 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  hitchhiker  0.00554858 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 661 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  24.26 
 
 		 580 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  26.71 
 
 		 780 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 234 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  24.39 
 
 		 507 aa  52  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 363 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  31.78 
 
 		 241 aa  51.6  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 209 aa  51.2  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  33 
 
 		 268 aa  50.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 369 aa  50.4  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  42.19 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  23.88 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 268 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 268 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  27.42 
 
 		 403 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 278 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 422 aa  47  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.88 
 
 		 402 aa  47  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.04 
 
 		 287 aa  47  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  26.95 
 
 		 704 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2200  16S rRNA methyltransferase GidB  30.63 
 
 		 220 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2267  16S rRNA methyltransferase GidB  29.86 
 
 		 219 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  34.15 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  26.89 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  38.1 
 
 		 230 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  23.14 
 
 		 269 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 266 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.34 
 
 		 386 aa  45.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4218  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.88 
 
 		 216 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.646333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  25.85 
 
 		 359 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  24.22 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3746  putative methyltransferase  25.87 
 
 		 224 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  22.31 
 
 		 269 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  36 
 
 		 356 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1269  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 263 aa  45.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.61 
 
 		 865 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  30.68 
 
 		 199 aa  44.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000768937  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07365  glucose-inhibited division protein  30.26 
 
 		 209 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0268535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  23.77 
 
 		 269 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  32.86 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  36.62 
 
 		 376 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 360 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 268 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 264 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  34.67 
 
 		 356 aa  44.3  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  30.34 
 
 		 351 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  25.47 
 
 		 400 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 360 aa  44.3  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 285 aa  44.3  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 250 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  31.13 
 
 		 230 aa  44.3  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>