88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3078 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  100 
 
 		 512 aa  1027    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  38.69 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  32.02 
 
 		 510 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 590 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  32.4 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  33.09 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  33.09 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  32.79 
 
 		 514 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  29.86 
 
 		 499 aa  140  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  30.34 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  25.14 
 
 		 508 aa  96.3  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  23.48 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  28.36 
 
 		 507 aa  90.5  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  22.82 
 
 		 514 aa  90.1  9e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  26.79 
 
 		 535 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  25.08 
 
 		 523 aa  87.8  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  28.35 
 
 		 542 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  24.58 
 
 		 518 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  24.81 
 
 		 564 aa  80.1  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  23.9 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  27.33 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  24.32 
 
 		 521 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  25.62 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  26.44 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  34.16 
 
 		 252 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  22.93 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  23.27 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  28.57 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  32.9 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  23.55 
 
 		 1143 aa  57  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  21.23 
 
 		 1144 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  32.79 
 
 		 414 aa  53.5  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.89 
 
 		 257 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2125  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.22 
 
 		 227 aa  51.2  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1935  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 285 aa  51.2  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  28.95 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.12 
 
 		 402 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3396  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 198 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.06 
 
 		 281 aa  49.3  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  40.68 
 
 		 298 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  47.46 
 
 		 249 aa  48.5  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  33.91 
 
 		 223 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.68 
 
 		 276 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  40.85 
 
 		 299 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  35.24 
 
 		 237 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  31.54 
 
 		 203 aa  47.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  33.03 
 
 		 400 aa  47.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  39.2 
 
 		 271 aa  47  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  36.62 
 
 		 301 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  29.63 
 
 		 399 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  31.03 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 271 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  34.55 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  35.42 
 
 		 276 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  39.34 
 
 		 279 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 355 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 355 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 355 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  40.98 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.34 
 
 		 258 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  26.47 
 
 		 1287 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3286  SAM-dependent methyltransferase  28.83 
 
 		 378 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  32.14 
 
 		 541 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.91 
 
 		 258 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  36.07 
 
 		 277 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  42.59 
 
 		 286 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  43.1 
 
 		 363 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.07 
 
 		 277 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.25 
 
 		 211 aa  44.3  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 353 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  29.57 
 
 		 234 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  35 
 
 		 234 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 246 aa  44.3  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 440 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  32.54 
 
 		 541 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0888  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.97 
 
 		 258 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.517085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  35.71 
 
 		 541 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 402 aa  43.5  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  35.71 
 
 		 541 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 274 aa  43.5  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 256 aa  43.5  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>