36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1066 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  100 
 
 		 511 aa  1046    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  51.37 
 
 		 511 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  44.1 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  40.85 
 
 		 510 aa  353  4e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  37 
 
 		 499 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  36.86 
 
 		 518 aa  242  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  32.4 
 
 		 512 aa  156  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  32.58 
 
 		 590 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  34.68 
 
 		 499 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  34.68 
 
 		 499 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  34.68 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  34.43 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  34.43 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  34.43 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  34.43 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  29.66 
 
 		 488 aa  123  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  27.73 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  26.69 
 
 		 518 aa  100  7e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  26.69 
 
 		 523 aa  99.8  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  25.96 
 
 		 514 aa  94  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  27.31 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  27.47 
 
 		 482 aa  92.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  28.53 
 
 		 507 aa  90.1  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  24.62 
 
 		 508 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  29.89 
 
 		 542 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  27.8 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  23.69 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  26.52 
 
 		 535 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  27.14 
 
 		 521 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  26.67 
 
 		 564 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  29.48 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  24.2 
 
 		 535 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  26.74 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  30.83 
 
 		 252 aa  67  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  23.7 
 
 		 1144 aa  54.3  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 1143 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>