129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0277 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
482 aa  998    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
518 aa  238  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  40.44 
 
 
523 aa  216  9e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  41.44 
 
 
494 aa  210  5e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  40.83 
 
 
521 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 
542 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  35.8 
 
 
564 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  30.22 
 
 
514 aa  179  9e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  36.36 
 
 
508 aa  177  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  26.18 
 
 
535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  35.34 
 
 
486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  33.58 
 
 
535 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  35.91 
 
 
509 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  32.21 
 
 
535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  35.27 
 
 
503 aa  144  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  30.6 
 
 
419 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 
1144 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  37.33 
 
 
252 aa  117  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 
1143 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  27.47 
 
 
511 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  25.71 
 
 
1116 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  27.3 
 
 
518 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  25 
 
 
499 aa  89  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  24.62 
 
 
510 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  28.64 
 
 
514 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  23.9 
 
 
512 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  24.75 
 
 
511 aa  73.6  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  21.14 
 
 
590 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  21.67 
 
 
499 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  21.67 
 
 
499 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  21.67 
 
 
499 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  21.67 
 
 
499 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  21.67 
 
 
499 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  21.29 
 
 
499 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  21.29 
 
 
499 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  28.83 
 
 
488 aa  64.3  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
439 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  33 
 
 
268 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  33 
 
 
268 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  28.91 
 
 
395 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
262 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.29 
 
 
447 aa  53.5  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  27.27 
 
 
779 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 
444 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
661 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  29.9 
 
 
263 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.07 
 
 
865 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  27.94 
 
 
399 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  29.75 
 
 
400 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  36 
 
 
580 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  27.87 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
283 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
355 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
355 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
355 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 
272 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5884  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.11 
 
 
422 aa  51.2  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0711978  normal  0.210944 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  28.09 
 
 
258 aa  50.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
279 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
279 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
779 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  29.75 
 
 
400 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  30.61 
 
 
234 aa  50.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  24.3 
 
 
440 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  26.19 
 
 
403 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.82 
 
 
232 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
209 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
245 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0129  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.47 
 
 
403 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.483434  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  25.77 
 
 
258 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.45 
 
 
251 aa  48.5  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  29.63 
 
 
246 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  27.08 
 
 
210 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  28.97 
 
 
230 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  27 
 
 
289 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1388  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.19 
 
 
407 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.420857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 
390 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
250 aa  47.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  28.71 
 
 
268 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4840  methyltransferase type 11  24.53 
 
 
341 aa  47  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531482  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  26.09 
 
 
422 aa  47  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1504  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.37 
 
 
409 aa  47  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.250201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2544  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.65 
 
 
419 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2929  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.65 
 
 
419 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  31.31 
 
 
220 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0798  cyclopropane fatty acid synthase-like protein  27.45 
 
 
374 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000275065  hitchhiker  2.13005e-17 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  31.18 
 
 
653 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  24.74 
 
 
268 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1672  Methyltransferase type 12  28 
 
 
265 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1395  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.56 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  28.57 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0725  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.49 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0644252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
235 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.53 
 
 
268 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.51 
 
 
258 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0954  methyltransferase type 12  25.77 
 
 
343 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.27 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1509  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.66 
 
 
424 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  25.66 
 
 
263 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  25.36 
 
 
224 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>