More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0198 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  26.21 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 
274 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
415 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  24.53 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.91 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  23.56 
 
 
204 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
250 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.32 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
252 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.31 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
252 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  29.82 
 
 
212 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
272 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  33.68 
 
 
221 aa  59.3  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
256 aa  58.9  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  29.9 
 
 
207 aa  58.5  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  31.48 
 
 
250 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  23.56 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.31 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  34.29 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  22.99 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.38 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  34.65 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  23.56 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.67 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
710 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  24.05 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.67 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
301 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
285 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  34.02 
 
 
235 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  24.72 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
285 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.31 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
267 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  28.36 
 
 
254 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
250 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  30 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  30 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.96 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 
239 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.31 
 
 
256 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  35.11 
 
 
238 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.31 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
243 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  25.93 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.8 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  34.02 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  26.98 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.31 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  30.19 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  36.08 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  28.44 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  32.98 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.52 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  25.21 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.3 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.78 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  27.18 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  27.18 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  27.18 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.91 
 
 
233 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  28.72 
 
 
523 aa  52.4  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.38 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000217887  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  28.72 
 
 
264 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
244 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>