More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0258 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  100 
 
 		 250 aa  513  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  33.19 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 265 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  29.72 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  29.91 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.91 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.42 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.54 
 
 		 252 aa  101  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.57 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4417  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 269 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.587336 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1222  methyltransferase  30.43 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.24 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  39.87 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  30.04 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 		 226 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.89 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  28.77 
 
 		 248 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  31.33 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.12 
 
 		 155 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  28.45 
 
 		 244 aa  85.1  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.67 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  46.09 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  40.98 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.64 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.88 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  26.29 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.79 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.74 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  26.07 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  32.47 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0574  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  37.86 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.45 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.08 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  36.89 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  32 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.35 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  36.57 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.26 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.9 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  40.78 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.72 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.88 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.94 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.48 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.6 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.87 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  38.39 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  40.18 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1338  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  26.76 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.56 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.375212  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.32 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.6 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  26.76 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.92 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  32.76 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.86 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.24 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.44 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.24 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  28.26 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  33.96 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.03 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  32.5 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.6 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.39 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>