96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1732 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  988    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  37.19 
 
 		 509 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  35.33 
 
 		 542 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  31.73 
 
 		 535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  29.49 
 
 		 564 aa  190  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  30.79 
 
 		 494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 535 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  33.2 
 
 		 535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  35.9 
 
 		 523 aa  182  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 		 518 aa  180  5.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  40.49 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  25.42 
 
 		 482 aa  158  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  32.67 
 
 		 521 aa  157  6e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  27.78 
 
 		 514 aa  155  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  29.47 
 
 		 508 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  28.83 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 1143 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  42.5 
 
 		 252 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  34.52 
 
 		 1144 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  26.39 
 
 		 1116 aa  111  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  33.59 
 
 		 518 aa  95.1  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  30.61 
 
 		 499 aa  93.2  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  32.52 
 
 		 499 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  32.52 
 
 		 499 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  29.03 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  28.42 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  27.53 
 
 		 488 aa  66.6  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  32.52 
 
 		 590 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5944  methyltransferase type 12  32.05 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.14 
 
 		 356 aa  54.3  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  27.78 
 
 		 507 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.98 
 
 		 343 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.56 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.15 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2187  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.94 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000137884  hitchhiker  0.000179759 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  32.14 
 
 		 274 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38159  predicted protein  28.85 
 
 		 343 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  30.28 
 
 		 234 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 250 aa  47.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33 
 
 		 209 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  29.2 
 
 		 235 aa  47.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4840  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 341 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1672  Methyltransferase type 12  28.18 
 
 		 265 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 268 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 215 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 268 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  34.86 
 
 		 230 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0352  RNA methyltransferase  36.2 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4553  methyltransferase  30.58 
 
 		 261 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 267 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.09 
 
 		 232 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  34.07 
 
 		 2082 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 283 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37510  hypothetical protein  34 
 
 		 282 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00412109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 204 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  28.57 
 
 		 241 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.37 
 
 		 299 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  27.43 
 
 		 235 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  28.77 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  28.77 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  28.89 
 
 		 224 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  25 
 
 		 268 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.88 
 
 		 248 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  33.75 
 
 		 340 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  26.8 
 
 		 245 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  29.63 
 
 		 246 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  24.6 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  31.07 
 
 		 1287 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.65 
 
 		 268 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6510  methyltransferase type 12  29.79 
 
 		 320 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6101  methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 320 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 263 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  29.79 
 
 		 653 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1319  methyltransferase type 12  29.79 
 
 		 320 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  27.73 
 
 		 300 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 357 aa  43.9  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0814  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 		 411 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1504  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.73 
 
 		 409 aa  43.9  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.250201  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 268 aa  43.9  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  30.51 
 
 		 266 aa  43.9  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 235 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  27.51 
 
 		 260 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.66 
 
 		 255 aa  43.5  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  35.43 
 
 		 439 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  31.15 
 
 		 253 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>