61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3432 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  970    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  32.19 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  32.5 
 
 		 499 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  29.59 
 
 		 518 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  31.29 
 
 		 510 aa  121  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  30.85 
 
 		 499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  30.85 
 
 		 499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  30.85 
 
 		 499 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  30.6 
 
 		 499 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  30.6 
 
 		 499 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  30.6 
 
 		 499 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  30.6 
 
 		 499 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  29.78 
 
 		 590 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  24.69 
 
 		 511 aa  94.4  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  28.36 
 
 		 512 aa  92.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  28.73 
 
 		 514 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  22.95 
 
 		 508 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  22.37 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  21.01 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  25.81 
 
 		 1144 aa  64.3  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 1143 aa  63.9  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  21.82 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  19.59 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  22.07 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  23.22 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  24.04 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  28.26 
 
 		 535 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 202 aa  55.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  26.83 
 
 		 503 aa  55.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  24.81 
 
 		 535 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  24.12 
 
 		 542 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.17 
 
 		 258 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 360 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 208 aa  50.4  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  23.65 
 
 		 564 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 355 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0995  hypothetical protein  27.85 
 
 		 316 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 355 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0672  putative RNA methylase  25.68 
 
 		 282 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 355 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  24.03 
 
 		 509 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 265 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.88 
 
 		 402 aa  47.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  33.05 
 
 		 376 aa  47  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  30.95 
 
 		 274 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.34 
 
 		 212 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  25 
 
 		 1116 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50330  hypothetical protein  28.37 
 
 		 253 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.271099  hitchhiker  0.000351246 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 278 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.91 
 
 		 346 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  27.72 
 
 		 1274 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 273 aa  45.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 367 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  19.9 
 
 		 482 aa  43.9  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  35 
 
 		 246 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 276 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  31 
 
 		 251 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>