160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0362 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  100 
 
 
518 aa  1032    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  36.22 
 
 
510 aa  295  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  36.91 
 
 
511 aa  257  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  38.26 
 
 
488 aa  243  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  31.8 
 
 
511 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  33.65 
 
 
514 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  37.92 
 
 
499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  38.4 
 
 
512 aa  232  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  35.32 
 
 
499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  35.32 
 
 
499 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  35.32 
 
 
499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  35.32 
 
 
499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  35.32 
 
 
499 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  35.32 
 
 
499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  35.32 
 
 
499 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  35 
 
 
590 aa  194  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  29.82 
 
 
507 aa  136  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  31.89 
 
 
535 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  29.23 
 
 
514 aa  118  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  30.87 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  26.77 
 
 
508 aa  114  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  28.75 
 
 
486 aa  114  6e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  30.03 
 
 
542 aa  113  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  31.01 
 
 
523 aa  113  9e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  28.3 
 
 
509 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  25.4 
 
 
494 aa  107  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  28.62 
 
 
564 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  26.33 
 
 
521 aa  105  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  33.2 
 
 
535 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  26.33 
 
 
518 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  33.98 
 
 
503 aa  97.4  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  36.11 
 
 
535 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  39.57 
 
 
252 aa  95.5  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  27.92 
 
 
482 aa  93.6  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  31.95 
 
 
1143 aa  90.5  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  28 
 
 
1144 aa  82.8  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  30.42 
 
 
1116 aa  78.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
344 aa  60.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  30.54 
 
 
541 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  31.45 
 
 
268 aa  58.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50330  hypothetical protein  28.97 
 
 
253 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.271099  hitchhiker  0.000351246 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  29.94 
 
 
541 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  34.13 
 
 
541 aa  57.4  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  34.13 
 
 
541 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  30.56 
 
 
399 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 
360 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  32.62 
 
 
307 aa  55.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
541 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  35.59 
 
 
280 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  35.59 
 
 
280 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  40.51 
 
 
366 aa  54.3  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  37.25 
 
 
360 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
263 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  37.25 
 
 
369 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  34.18 
 
 
395 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
283 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
226 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
355 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
355 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  35.85 
 
 
376 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
355 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
348 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  29.77 
 
 
414 aa  51.2  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  46.67 
 
 
316 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 
400 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  25.23 
 
 
256 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  34.62 
 
 
353 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
234 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  45.07 
 
 
444 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
353 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  29.92 
 
 
399 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  33.56 
 
 
351 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
440 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
258 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1315  Methyltransferase type 12  35.46 
 
 
179 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  27.45 
 
 
269 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  26.14 
 
 
269 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  30.47 
 
 
275 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  38.32 
 
 
349 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  31.71 
 
 
1140 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0720096  normal  0.188853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
390 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  29.06 
 
 
400 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  25.99 
 
 
269 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 
286 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5079  methyltransferase type 12  31.07 
 
 
238 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5167  methyltransferase type 12  31.07 
 
 
238 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  34.58 
 
 
348 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  25.42 
 
 
269 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
275 aa  47.8  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.63 
 
 
299 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
234 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_586  methyltransferase  33.62 
 
 
293 aa  47.4  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00349861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1966  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
264 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34 
 
 
402 aa  47  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
257 aa  47  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  39.74 
 
 
353 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  31.39 
 
 
351 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
209 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  34.91 
 
 
351 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>