More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1315 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1315  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 179 aa  335  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4711  Methyltransferase type 11  37.88 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4275  methyltransferase type 11  36.81 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1980  Methyltransferase type 12  31.65 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.546163  normal  0.238545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.94 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 259 aa  57.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  38.84 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3155  methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.290736  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.04 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.51 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  35.45 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 348 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 264 aa  54.3  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  39.82 
 
 		 263 aa  54.3  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5724  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 337 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.85 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 273 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0464  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.03 
 
 		 421 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  34.82 
 
 		 258 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.97 
 
 		 257 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  23.28 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 327 aa  52  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 262 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 247 aa  52  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 243 aa  51.6  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1672  Methyltransferase type 12  26.36 
 
 		 265 aa  51.6  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  36.79 
 
 		 354 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 263 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  26.77 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.8 
 
 		 250 aa  51.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  34.48 
 
 		 261 aa  51.6  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.32 
 
 		 258 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 349 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.08 
 
 		 229 aa  51.2  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.45 
 
 		 463 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.45 
 
 		 463 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.45 
 
 		 449 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 		 262 aa  51.2  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  35.45 
 
 		 342 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.94 
 
 		 241 aa  50.8  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2597  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 236 aa  50.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 272 aa  50.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 260 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.86 
 
 		 260 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.8 
 
 		 346 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 257 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.58 
 
 		 277 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 236 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3348  methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 		 250 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  40.17 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  35.14 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  41.33 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.04 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.5 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 288 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6852  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  0.739847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.44 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  40.52 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3168  hypothetical protein  30.77 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  35.06 
 
 		 279 aa  49.3  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  36.15 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  30.4 
 
 		 355 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.63 
 
 		 541 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.5 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.5 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  29.63 
 
 		 541 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.11 
 
 		 410 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.71 
 
 		 234 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.15 
 
 		 247 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 317 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.06 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 288 aa  48.9  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 254 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.7 
 
 		 259 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  30 
 
 		 246 aa  48.9  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 253 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  29.63 
 
 		 541 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.79 
 
 		 234 aa  48.5  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  29.63 
 
 		 541 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 339 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  36.09 
 
 		 286 aa  48.5  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4387  hypothetical protein  26.9 
 
 		 247 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562603  normal  0.249207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>