51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3168 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3168  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  343  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1980  Methyltransferase type 12  43.45 
 
 		 177 aa  127  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.546163  normal  0.238545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4711  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5724  methyltransferase type 11  40.79 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  24.73 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2192  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  25.18 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1464  Methyltransferase type 12  39.74 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.314215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  21.51 
 
 		 196 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2597  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 236 aa  51.2  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3155  methyltransferase type 12  30.95 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.290736  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3348  methyltransferase type 12  31.75 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1315  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  22.58 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  22.58 
 
 		 196 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.2 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  21.51 
 
 		 208 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7117  Methyltransferase type 11  26.6 
 
 		 229 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.829004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1151  SAM-dependent methyltransferase for cell envelope biogenesis  27.47 
 
 		 314 aa  44.7  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 198 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 198 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.64 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.65 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.53 
 
 		 268 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4275  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  21.19 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  27.12 
 
 		 258 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 264 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.21 
 
 		 260 aa  42  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  28.57 
 
 		 256 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 		 206 aa  41.6  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6157  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 258 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  22.52 
 
 		 266 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.73 
 
 		 386 aa  41.6  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  22.52 
 
 		 266 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.28 
 
 		 258 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.28 
 
 		 258 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 239 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 258 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 239 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 255 aa  40.8  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 208 aa  40.8  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  28.04 
 
 		 249 aa  40.8  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>