197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3348 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3348  methyltransferase type 12  100 
 
 		 144 aa  279  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3155  methyltransferase type 12  92.91 
 
 		 144 aa  254  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.290736  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2192  Methyltransferase type 12  61.59 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5724  methyltransferase type 11  58.27 
 
 		 143 aa  147  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1464  Methyltransferase type 12  56.12 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.314215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4711  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1980  Methyltransferase type 12  36.15 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.546163  normal  0.238545 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.56 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  29.01 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 272 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 231 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4275  methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 236 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  27.1 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1315  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  31.85 
 
 		 275 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 260 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 269 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 207 aa  50.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 275 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 239 aa  50.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 240 aa  50.4  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 269 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 		 254 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3168  hypothetical protein  31.75 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  26.17 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 233 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  30.23 
 
 		 258 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.85 
 
 		 228 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  28.04 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  31.01 
 
 		 258 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  26.17 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  25.23 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 286 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  27.66 
 
 		 287 aa  47.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.48 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.47 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  27.69 
 
 		 275 aa  47.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  31.21 
 
 		 663 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  32.61 
 
 		 263 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 280 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.92 
 
 		 258 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.03 
 
 		 229 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.29 
 
 		 241 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 285 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 285 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.44 
 
 		 285 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0628  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.45 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.17 
 
 		 256 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.92 
 
 		 256 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  32.82 
 
 		 249 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.07 
 
 		 223 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  35.29 
 
 		 273 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.09 
 
 		 343 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  34.96 
 
 		 253 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 278 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 250 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.17 
 
 		 256 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 280 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  29.31 
 
 		 273 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 273 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 190 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  30.58 
 
 		 234 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 275 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 337 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.05 
 
 		 250 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3694  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 285 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00559242  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.17 
 
 		 256 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.75 
 
 		 268 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 270 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 270 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 270 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 344 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 256 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 220 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.17 
 
 		 256 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 255 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 247 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0410  hypothetical protein  25.98 
 
 		 266 aa  43.5  0.0009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.404807  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 230 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  27.93 
 
 		 343 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2548  methyltransferase, putative  36.84 
 
 		 333 aa  42.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 264 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 290 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2597  methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 236 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0485  methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 284 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 282 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  27.48 
 
 		 285 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.93 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>